В сезоне 2012/2013 гг. клуб постоянно несет денежные наказания после проведения домашних встреч. По общему количеству денежных наказаний из-за неподобающего поведения зрителей на домашних матчах «Шинник» продолжает занимать третье место среди всех команд ФНЛ.
Руководство клуба вновь было вынуждено обратиться к ярославским болельщикам с убедительной просьбой соблюдать на трибунах порядок во время матчей.